MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 101352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009525	CGC	2	6	136643	136648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659874
3002	NC_009525	TCGCCG	2	12	136653	136664	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148659874
3003	NC_009525	GCC	2	6	136766	136771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659874
3004	NC_009525	GGCC	2	8	136885	136892	0 %	0 %	50 %	50 %	148659874
3005	NC_009525	CGTTG	2	10	136928	136937	0 %	40 %	40 %	20 %	148659874
3006	NC_009525	TCG	2	6	136942	136947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3007	NC_009525	CGACC	2	10	137000	137009	20 %	0 %	20 %	60 %	148659874
3008	NC_009525	AGCG	2	8	137038	137045	25 %	0 %	50 %	25 %	148659874
3009	NC_009525	CAC	2	6	137084	137089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659874
3010	NC_009525	CGG	2	6	137105	137110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659874
3011	NC_009525	GGA	2	6	137138	137143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659874
3012	NC_009525	CAA	2	6	137225	137230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659874
3013	NC_009525	ATG	2	6	137678	137683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659875
3014	NC_009525	GCC	2	6	137711	137716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659875
3015	NC_009525	CTAC	2	8	137733	137740	25 %	25 %	0 %	50 %	148659875
3016	NC_009525	CGG	2	6	137877	137882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659875
3017	NC_009525	CCGG	2	8	137893	137900	0 %	0 %	50 %	50 %	148659875
3018	NC_009525	ACC	2	6	137912	137917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659875
3019	NC_009525	CGCA	2	8	137967	137974	25 %	0 %	25 %	50 %	148659875
3020	NC_009525	ATT	2	6	137978	137983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148659875
3021	NC_009525	TCG	2	6	137993	137998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659875
3022	NC_009525	TTG	2	6	138012	138017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659875
3023	NC_009525	GCG	2	6	138043	138048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659875
3024	NC_009525	GGC	2	6	138085	138090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659875
3025	NC_009525	CGT	2	6	138139	138144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659875
3026	NC_009525	CCG	2	6	138205	138210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659875
3027	NC_009525	TGATGC	2	12	138312	138323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148659875
3028	NC_009525	CTT	2	6	138452	138457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659875
3029	NC_009525	CGA	2	6	138466	138471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659875
3030	NC_009525	ATC	2	6	138476	138481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659875
3031	NC_009525	GCA	2	6	138492	138497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659875
3032	NC_009525	GGC	2	6	138502	138507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659875
3033	NC_009525	CAA	2	6	138521	138526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659875
3034	NC_009525	ATT	2	6	138564	138569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148659875
3035	NC_009525	CTG	2	6	138694	138699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659876
3036	NC_009525	TG	3	6	138826	138831	0 %	50 %	50 %	0 %	148659876
3037	NC_009525	GGT	2	6	138837	138842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659876
3038	NC_009525	TCG	2	6	138936	138941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659876
3039	NC_009525	GTT	2	6	139104	139109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659876
3040	NC_009525	CGG	2	6	139127	139132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659876
3041	NC_009525	TCA	2	6	139355	139360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659877
3042	NC_009525	TACG	2	8	139381	139388	25 %	25 %	25 %	25 %	148659877
3043	NC_009525	GGC	2	6	139394	139399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659877
3044	NC_009525	GCG	2	6	139420	139425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659877
3045	NC_009525	GAA	2	6	139434	139439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659877
3046	NC_009525	CAG	2	6	139480	139485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659877
3047	NC_009525	TGA	2	6	139502	139507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659877
3048	NC_009525	CAC	2	6	139597	139602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659877
3049	NC_009525	GAC	2	6	139661	139666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659877
3050	NC_009525	CA	3	6	139730	139735	50 %	0 %	0 %	50 %	148659877
3051	NC_009525	CGC	2	6	139740	139745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659877
3052	NC_009525	TGC	2	6	139746	139751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659877
3053	NC_009525	G	6	6	139856	139861	0 %	0 %	100 %	0 %	148659877
3054	NC_009525	CGG	2	6	139913	139918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659878
3055	NC_009525	GAGAT	2	10	140020	140029	40 %	20 %	40 %	0 %	148659878
3056	NC_009525	TCGC	2	8	140036	140043	0 %	25 %	25 %	50 %	148659878
3057	NC_009525	TCGA	2	8	140070	140077	25 %	25 %	25 %	25 %	148659878
3058	NC_009525	TC	3	6	140088	140093	0 %	50 %	0 %	50 %	148659878
3059	NC_009525	GAA	2	6	140094	140099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148659878
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3061	NC_009525	GGT	2	6	140151	140156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659878
3062	NC_009525	CTC	2	6	140194	140199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659878
3063	NC_009525	TCG	2	6	140217	140222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659878
3064	NC_009525	TGG	3	9	140230	140238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659878
3065	NC_009525	TCG	2	6	140271	140276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659878
3066	NC_009525	GGT	2	6	140340	140345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659878
3067	NC_009525	CGC	2	6	140360	140365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659878
3068	NC_009525	CGG	2	6	140372	140377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659878
3069	NC_009525	GTG	2	6	140415	140420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659878
3070	NC_009525	CGG	2	6	140436	140441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659878
3071	NC_009525	CTT	2	6	140469	140474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659878
3072	NC_009525	CGG	2	6	140483	140488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659878
3073	NC_009525	GTC	2	6	140501	140506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659878
3074	NC_009525	CAA	2	6	140523	140528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659878
3075	NC_009525	GTC	2	6	140535	140540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659878
3076	NC_009525	GACGCG	2	12	140547	140558	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148659878
3077	NC_009525	CACT	2	8	140567	140574	25 %	25 %	0 %	50 %	148659878
3078	NC_009525	TCT	2	6	140606	140611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659878
3079	NC_009525	GTG	2	6	140613	140618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659878
3080	NC_009525	ATG	2	6	140784	140789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659878
3081	NC_009525	CGCA	2	8	140819	140826	25 %	0 %	25 %	50 %	148659878
3082	NC_009525	GGA	2	6	140844	140849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659878
3083	NC_009525	TG	3	6	140977	140982	0 %	50 %	50 %	0 %	148659878
3084	NC_009525	CGA	2	6	140998	141003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659878
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3086	NC_009525	TGT	2	6	141338	141343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659879
3087	NC_009525	CGA	2	6	141364	141369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659879
3088	NC_009525	GGGC	2	8	141372	141379	0 %	0 %	75 %	25 %	148659879
3089	NC_009525	GCT	2	6	141386	141391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659879
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3091	NC_009525	GACC	2	8	141740	141747	25 %	0 %	25 %	50 %	148659880
3092	NC_009525	CGC	2	6	141769	141774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659880
3093	NC_009525	GGC	2	6	141910	141915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659880
3094	NC_009525	ACG	2	6	141928	141933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659880
3095	NC_009525	GGA	2	6	141946	141951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659880
3096	NC_009525	CTG	2	6	141963	141968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659880
3097	NC_009525	CACC	2	8	142048	142055	25 %	0 %	0 %	75 %	148659880
3098	NC_009525	CACC	2	8	142091	142098	25 %	0 %	0 %	75 %	148659880
3099	NC_009525	CGGCG	2	10	142174	142183	0 %	0 %	60 %	40 %	148659880
3100	NC_009525	GTG	2	6	142197	142202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659880
3101	NC_009525	CAC	3	9	142208	142216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659880
3102	NC_009525	CAC	2	6	142232	142237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659880
3103	NC_009525	CGG	2	6	142297	142302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659880
3104	NC_009525	CTGA	2	8	142311	142318	25 %	25 %	25 %	25 %	148659880
3105	NC_009525	GATA	2	8	142356	142363	50 %	25 %	25 %	0 %	148659880
3106	NC_009525	TCG	2	6	142584	142589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659881
3107	NC_009525	TGG	2	6	142749	142754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659881
3108	NC_009525	TGCGG	2	10	142807	142816	0 %	20 %	60 %	20 %	148659881
3109	NC_009525	ACG	2	6	142865	142870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659881
3110	NC_009525	GGCT	2	8	142935	142942	0 %	25 %	50 %	25 %	148659881
3111	NC_009525	TGA	2	6	143017	143022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659881
3112	NC_009525	GAG	2	6	143045	143050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659881
3113	NC_009525	TGT	2	6	143061	143066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659881
3114	NC_009525	CGG	2	6	143070	143075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659881
3115	NC_009525	TGC	2	6	143079	143084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659881
3116	NC_009525	CGC	2	6	143176	143181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659881
3117	NC_009525	GTG	2	6	143325	143330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659881
3118	NC_009525	CG	3	6	143336	143341	0 %	0 %	50 %	50 %	148659881
3119	NC_009525	GC	3	6	143436	143441	0 %	0 %	50 %	50 %	148659881
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3121	NC_009525	CGC	2	6	143495	143500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659881
3122	NC_009525	CGCTG	2	10	143514	143523	0 %	20 %	40 %	40 %	148659882
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3241	NC_009525	CG	3	6	148482	148487	0 %	0 %	50 %	50 %	148659884
3242	NC_009525	CCT	2	6	148488	148493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659884
3243	NC_009525	TGA	2	6	148689	148694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659884
3244	NC_009525	CG	3	6	148699	148704	0 %	0 %	50 %	50 %	148659884
3245	NC_009525	TCG	2	6	148751	148756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3246	NC_009525	CGG	2	6	148794	148799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659884
3247	NC_009525	CGA	2	6	148851	148856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3248	NC_009525	CGT	2	6	148872	148877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
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3264	NC_009525	CGT	2	6	149519	149524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659885
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3270	NC_009525	TCG	2	6	150052	150057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659886
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3279	NC_009525	AGG	2	6	150294	150299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659887
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3362	NC_009525	TGC	2	6	152892	152897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659889
3363	NC_009525	CGG	2	6	152925	152930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659889
3364	NC_009525	GGC	2	6	152939	152944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659889
3365	NC_009525	CGT	2	6	152962	152967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659889
3366	NC_009525	GGT	2	6	153022	153027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659889
3367	NC_009525	CGGG	2	8	153129	153136	0 %	0 %	75 %	25 %	148659889
3368	NC_009525	CGT	2	6	153139	153144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659889
3369	NC_009525	GGT	2	6	153160	153165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659889
3370	NC_009525	GGCGAT	2	12	153241	153252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148659889
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3373	NC_009525	ACA	2	6	153333	153338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659889
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3381	NC_009525	ATCG	2	8	153896	153903	25 %	25 %	25 %	25 %	148659890
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3385	NC_009525	TGC	2	6	154008	154013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659890
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3393	NC_009525	ATC	2	6	154214	154219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659890
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3472	NC_009525	TACC	2	8	157667	157674	25 %	25 %	0 %	50 %	148659892
3473	NC_009525	TCAA	2	8	157699	157706	50 %	25 %	0 %	25 %	148659892
3474	NC_009525	AGGCG	2	10	157746	157755	20 %	0 %	60 %	20 %	148659892
3475	NC_009525	GGC	2	6	157940	157945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659893
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3480	NC_009525	TGGT	2	8	158115	158122	0 %	50 %	50 %	0 %	148659893
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3482	NC_009525	CGC	2	6	158164	158169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659893
3483	NC_009525	GTT	2	6	158216	158221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659893
3484	NC_009525	GGAC	2	8	158279	158286	25 %	0 %	50 %	25 %	148659893
3485	NC_009525	CCA	2	6	158348	158353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659893
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3491	NC_009525	TC	3	6	158515	158520	0 %	50 %	0 %	50 %	148659893
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